Деревня Средняя Агинка образовалось в 1929 году. Первыми жителями были семьи Шипицыных, Столяровых, Горбаренко, Соломко, Ткачук, Беспаловы, Голубевы. Семьи строили свое жилье в местах, где протекали реки и были родники. Многие места до сих пор носят фамилии первопоселенцев.Это Шипицин мост, Сенькин ключ, Лукашкино, Беспалово, Голодный лог, Голубево.
История
Деревня Средняя Агинка образовалось в 1929 году. Первыми жителями были семьи Шипицыных, Столяровых, Горбаренко, Соломко, Ткачук, Беспаловы, Голубевы. Семьи строили свое жилье в местах, где протекали реки и были родники. Многие места до сих пор носят фамилии первопоселенцев.Это Шипицин мост, Сенькин ключ, Лукашкино, Беспалово, Голодный лог, Голубево.
В годы коллективизации, когда стали образовываться первые колхозы, было решено создать одно селение. Населенный пункт Средняя Агинка, он назван так, потому что находился среди ключей, которые при слиянии образуют реку Ага.
Деревня Средняя Агинка состояла из двух улиц, на каждой улице был свой бригадир.Первый колхоз образовался в 1930 году и назывался он «Борец», в него входило 3 деревни:Средняя Агинка, Кулижниково, Шудрово. Первым председателем был СиратскийАлеям Трофимович. Во время Великой Отечественной войны из деревни ушло на фронт 152 человека, живыми вернулись 87 человек, погибло 39 человек, пропало без вести 26 человек.
С 1930 по 1963 год в колхозе «Борец» сменилось три председателя: Ващекин Михаил Михайлович, затем Столбовский Иван Матвеевич. В 1963 году образовался новый колхоз «Борец» в который вошли 5 деревень Средняя Агинка, Кулижниково, Орловка, Новобрянка, Шудрово Первым председателем был Грибеников Иван Андреевич.
В 1985 году путем разукрупнения колхоза «Борец», колхоз в деревне Средняя Агинка был переименован колхоз «Искра». Саянским районным Советом народных депутатов 20.11.1986 года было подписано решение № 258 «О разукрупнении Кулижниковского сельского Совета народных депутатов и образовании нового сельского Совета». Решением было принято разукрупнить сельский Совет на Кулижниковский и Средне-Агинский сельские Советы. На территории вновь образуемого сельского совета на 1986 год проживали 752 человека, избирателей 486. В ведомство Совета вошло село Средняя Агинка, деревня Шудрово перешли колхоз «Искра», сельский Дом культуры, клуб, две библиотеки, два магазина, два медпункта, начальная школ, ветучасток.Первым председателем нового колхоза был Федичкин Василий Петрович.С этого момента село расцвело, началось масштабное строительство, жизнь закипела. За четыре года усилиями наемных бригад в «Искре» возвели два телятника, а также коровник, возвели цементный склад, столярку, машинный двор вместе с гаражом, автозаправку, построили две откормочные площадки на восемьсот голов, обзавелись пчельней, развели пруды с карпам.Деревня преобразилась. Люди поверили в успех своего хозяйства, даже в деревни Шудрово усилиями колхоза построили новые современные дома, а также тракторный гараж, все это благодаря усилиям В.П. Федичкина. Усилиями В.П. Федичкина установили памятник ко дню победы в Великой Отечественной Войне в центре села, по сей день у жителей существует традиция проводить митинг на памятнике на день победы 9 мая.
Постановлением главы администрации Саянского района Н.М.Тикко от 23.01.1992 года № 4 «Об образовании сельских Администрации» сельсовет получил название «Средне-Агинская сельская администрация». 03.06.2004 Советом администрации Красноярского края выдано свидетельство о внесении муниципального образования в реестр муниципальных образований Красноярского края, регистрационный номер 48-04-02. С 2014 года Муниципальное образование Среднеагинский сельсовет переименовано как « Администрация Среднеагинского сельсовета».
С 2008 года на территории сельсовета работает Муниципальный пожарный пост в котором работаю пять пожарных
Среднеагинская СОШ – директор Ткачук Елена Михайловна
Средне-Агинский детский сад- заведующая Зинченко Наталья Васильевна
ФАП -фельдшер Разумный Дмитрий Александрович
Среднеагинский СДК-директор Разумная Евгения Ивановна
Среднеагинская сельская библиотека-заведующая Перцева Татьяна Владимировна
На селе имеется соц.работник Павлова Наталья Петровна